A Comissão Acadêmica de Pós-Graduação do PEnO foi criada em 2020 e é a responsável pela interface acadêmica entre o PEnO e a Comissão de Pós-Graduação e Pesquisa (CPGP) da COPPE|UFRJ. A comissão supervisiona os assuntos relacionados ao ensino e à pesquisa, assim como todas as atividades correlatas, atendendo as normas, resoluções e diretrizes acadêmicas da COPPE. Também estabelece, previa aprovação do Colegiado do PEnO, critérios específicos do PEnO na aplicação das normas mencionadas. A comissão do PEnO é composta por 4 membros: os dois representantes do PEnO na CPGP, o vice coordenador do programa e a secretaria acadêmica do programa.

• Profa. Bianca Pinheiro
• Prof. Jose Otavio Goulart Pecly (representante titular CPGP)
• Profa. Fernanda Fernanda Minikowski Achete (represente suplente CPGP)
• Prof. Marcos Nicolás Gallo (vice-coordenador)
• Sra. Lucianita Barbosa (secretaria Acadêmica)